Unele dintre civilizatiile din Peru sunt: Nazca, Wari, Mochica, Caral, Chimu, Tiahuanaco, Chavin, Paracas. Ei au fost urmate de puternice orase-state, cum ar fi Sipan, Cajamarca, si Chancay, si doua imperii: Chachapoyas si Chimor. Chimor, unii dintre Chachapoyas si multe orase-state au fost in cele din urma cucerite de incasilor.

Incasii (1438-1572) au creat cel mai mare imperiu din America pre-columbiana. Acesta provenea dintr-un trib din Cuzco, care a devenit capitala. Imperiul a fost impartit in patru provincii: Collasuyo, Contisuyo, Chinchasuyo si Antisuyo. Pentru ca a fost destul de mare, a avut un sistem impresionant de drumuri care lega toate partile imperiului, numit Inca Trail si chasquis, mesagerii care trasmiteau informatii de oriunde din imperiu la Cuzco. Economia sa se baza pe proprietatea de pamant colectiva.

Cand au venit spaniolii in 1531 teritoriul Perului era nucleul civilizatiei foarte dezvoltate incasilor. Cu centrul la Cuzco, Imperiul Inca s-a intins pe o vasta regiune de nordul Ecuadorului la zona centrala din Chile. In cautarea bogatiilor incasilor, exploratorul spaniol Francisco Pizarro, care a ajuns pe acest teritoriu dupa incasi, a pornit un razboi starnit un razboi civil, apoi a cucerit populatia slabita. Spaniolii au cucerit capitala incasa de la Cuzco pana in 1533 si si-au consolidat controlul asurpa acestora pana in 1542. Aurul si argintul din Anzi au imbogatit cuceritorii si Peru a devenit principala sursa de bogatie si putere din America de Sud pentru Spania.

Miscarea de independenta a Perului a fost condusa de Jose de San Martin si Simon Bolivar. San Martin a proclamat independenta peruana pe 28 iulie 1821. Emanciparea a fost finalizata in decembrie 1824 cand generalul Antonio José de Sucre a invins trupele spaniole la Ayacucho punand capat dominatiei spanioe in America de Sud.